Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot7Q60809 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot7Q60809 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms