Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mybpc2Q5XKE0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mybpc2Q5XKE0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mybpc2Q5XKE0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms