Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lmtk3Q5XJV6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk3Q5XJV6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmtk3Q5XJV6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmtk3Q5XJV6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms