Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc5a6Q5U4D8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms