Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam71bQ5STT6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam71bQ5STT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms