Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PkdccQ5RJI4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PkdccQ5RJI4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms