Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q5EBG8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q5EBG8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q5EBG8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q5EBG8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q5EBG8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q5EBG8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms