Protein–RNA interactions for Protein: Q5BL07

Pex1, Peroxisome biogenesis factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex1Q5BL07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pex1Q5BL07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pex1Q5BL07 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pex1Q5BL07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms