Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp13Q5BKP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp13Q5BKP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms