Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc47Q505F5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc47Q505F5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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