Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx49Q4FZF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx49Q4FZF3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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