Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd5Q3V1H9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd5Q3V1H9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd5Q3V1H9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd5Q3V1H9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd5Q3V1H9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd5Q3V1H9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd5Q3V1H9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms