Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chpf2Q3UU43 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chpf2Q3UU43 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chpf2Q3UU43 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Chpf2Q3UU43 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Chpf2Q3UU43 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chpf2Q3UU43 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chpf2Q3UU43 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms