Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sf3b2Q3UJB0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sf3b2Q3UJB0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.1 ms