Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc177Q3UHB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc177Q3UHB8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms