Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem109Q3UBX0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem109Q3UBX0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms