Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
YrdcQ3U5F4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YrdcQ3U5F4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
YrdcQ3U5F4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms