Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vars2Q3U2A8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Vars2Q3U2A8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms