Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrn4clQ3TYX2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn4clQ3TYX2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn4clQ3TYX2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms