Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TchpQ3TVW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TchpQ3TVW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 926.3 ms