Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc136Q3TVA9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms