Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col19a1Q0VF58 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col19a1Q0VF58 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms