Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shisal1Q0VBP7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms