Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubxn2bQ0KL01 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms