Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnma1Q08460 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms