Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F13bQ07968 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F13bQ07968 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F13bQ07968 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
F13bQ07968 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F13bQ07968 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
F13bQ07968 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F13bQ07968 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms