Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox4Q06831 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox4Q06831 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox4Q06831 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms