Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox10Q04888 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox10Q04888 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms