Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcr5Q04683 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms