Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cacna1sQ02789 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacna1sQ02789 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1sQ02789 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms