Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col6a2Q02788 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col6a2Q02788 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 396.3 ms