Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms