Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nhlh1Q02576 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlh1Q02576 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh1Q02576 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms