Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2cQ01098 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms