Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Serpina1cQ00896 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina1cQ00896 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina1cQ00896 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms