Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2P97817 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2P97817 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms