Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas1P97459 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas1P97459 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas1P97459 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas1P97459 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas1P97459 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas1P97459 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms