Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhodP97348 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhodP97348 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RhodP97348 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhodP97348 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhodP97348 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhodP97348 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhodP97348 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhodP97348 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhodP97348 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhodP97348 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhodP97348 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhodP97348 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RhodP97348 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhodP97348 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhodP97348 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhodP97348 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhodP97348 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RhodP97348 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhodP97348 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhodP97348 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhodP97348 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhodP97348 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhodP97348 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhodP97348 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhodP97348 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhodP97348 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhodP97348 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhodP97348 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhodP97348 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RhodP97348 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RhodP97348 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhodP97348 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhodP97348 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhodP97348 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhodP97348 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhodP97348 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RhodP97348 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhodP97348 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhodP97348 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhodP97348 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhodP97348 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhodP97348 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhodP97348 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhodP97348 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhodP97348 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms