Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vgll3P85442 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vgll3P85442 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms