Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cct3P80318 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cct3P80318 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cct3P80318 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cct3P80318 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cct3P80318 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cct3P80318 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cct3P80318 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms