Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf6P70279 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf6P70279 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf6P70279 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf6P70279 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms