Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf5P70191 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Traf5P70191 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf5P70191 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf5P70191 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf5P70191 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf5P70191 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf5P70191 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms