Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip1P63254 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crip1P63254 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip1P63254 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip1P63254 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crip1P63254 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crip1P63254 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crip1P63254 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms