Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc6P62334 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psmc6P62334 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms