Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc1P62192 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms