Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SnnP61807 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnnP61807 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnnP61807 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnnP61807 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnnP61807 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnnP61807 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnnP61807 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnnP61807 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnnP61807 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnnP61807 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnnP61807 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnnP61807 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SnnP61807 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnnP61807 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnnP61807 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnnP61807 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnnP61807 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnnP61807 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnnP61807 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnnP61807 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnnP61807 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnnP61807 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnnP61807 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnnP61807 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnnP61807 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnnP61807 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnnP61807 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnnP61807 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnnP61807 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnnP61807 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnnP61807 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnnP61807 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnnP61807 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnnP61807 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnnP61807 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnnP61807 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnnP61807 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnnP61807 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnnP61807 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnnP61807 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnnP61807 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnnP61807 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnnP61807 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnnP61807 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnnP61807 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnnP61807 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnnP61807 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnnP61807 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnnP61807 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SnnP61807 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnnP61807 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnnP61807 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnnP61807 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnnP61807 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnnP61807 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnnP61807 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnnP61807 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnnP61807 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms