Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d3P61079 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1481.5 ms