Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap25P60879 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snap25P60879 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snap25P60879 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap25P60879 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Snap25P60879 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snap25P60879 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap25P60879 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap25P60879 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snap25P60879 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms