Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paxbp1P58501 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paxbp1P58501 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms