Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dpf3P58269 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms